ГКПМ-Оболенск

Государственная коллекция патогенных микроорганизмов и клеточных культур (ГКПМ-Оболенск)

ГКПМ-Оболенск – специализированная коллекция, основными видами деятельности которой являются сбор, хранение и изучение патогенных штаммов бактерий, а также бактериофагов, грибов и клеточных линий.

Коллекция оказывает услуги:
  • депонирование (в том числе для целей национальной патентной процедуры) различных микроорганизмов;
  • предоставление тестовых штаммов (тест-культур, контрольных штаммов, референс-штаммов, стандартных эталонных штаммов), предназначенных для контроля качества питательных сред;
  • идентификация и изучение микроорганизмов.
Руководитель ГКПМ-Оболенск
  • Директор ФБУН ГНЦ ПМБ, академик РАН, д.м.н., профессор Дятлов Иван Алексеевич
Подразделение ФБУН ГНЦ ПМБ, ответственное за осуществление деятельности ГКПМ-Оболенск
  • Отдел коллекционных культур ФБУН ГНЦ ПМБ
Выдача* типовых (тестовых) штаммов микроорганизмов
  • Козлова Татьяна Павловна
    Тел.: +7 (4967) 36-00-30

*Для получения штаммов микроорганизмов необходимо подать заявку на бланке организации-заявителя. Заявка должна быть заверена подписью руководителя организации, приобретающей штамм и печатью организации. К заявке необходимо приложить копию лицензии на право работы с патогенными биологическими агентами. Для ускоренения процедуры получения штаммов ГКПМ-Оболенск рассматривает факсимильные и электронные копии документов. Заявки необходимо отправлять на факс: +7 (4967) 36-00-03 или электронный адрес: Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.. В заявке желательно указать контактные данные сотрудника, заинтересованного в получении штамма.

Список и стоимость услуг, предоставляемых Государственной коллекцией патогенных микроорганизмов ГКПМ-Оболенск
НаименованиеЦена
1. Выдача типовых штаммов микроорганизмов в лиофилизированном состоянии 2750 руб. за ампулу
2. Депонирование штамма микроорганизма для целей национальной патентной процедуры бесплатно
3. Депонирование клеточной линии для целей национальной патентной процедуры бесплатно
4. Выдача депозитору образца депонированного штамма 500 руб.
5. Идентификация микроорганизмов на системе MALDI-Biotyper:
1-3 культуры 1000 руб. за культуру
4-10 культур 750 руб. за культуру
≥11 культур 500 руб. за культуру
6. Идентификация микроорганизмов по последовательности 16SrRNA и на системе MALDI-Biotyper:
1-3 культуры 7000 руб. за культуру
4-10 культур 6000 руб. за культуру
≥11 культур 5000 руб. за культуру
7. Идентификация микроорганизмов на основании биохимических признаков с использованием системы микроб-автомат по договоренности
8. Идентификация микроорганизмов на основании биохимических признаков с использованием системы Biolog по договоренности
9. Идентификация микроорганизмов на основании биохимических признаков с использованием системы Vitek по договоренности
10. Определение метаболического профиля микроорганизма на системе Biolog по договоренности
11. Секвенирование генома микроорганизма на системах MiSeq и/или IonTorrent PGM (работы включают выделение ДНК микроорганизма, приготовление библиотеки, секвенирование, первичный биоинформационный анализ) от 30 000 руб. за геном
12. Наработка инактивированной биомассы микроорганизма по договоренности
13. Наработка препарата ДНК микроорганизма по договоренности
14. Другие микробиологические исследования по договоренности
Группа геномных исследований

Группа геномных исследований ФБУН ГНЦ ПМБ специализируется на изучении бактерий 1-4 групп патогенности, а также непатогенных микроорганизмов.

Подразделение ФБУН ГНЦ ПМБ, ответственное за осуществление деятельности ГКПМ-Оболенск
  • Отдел коллекционных культур ФБУН ГНЦ ПМБ
Руководитель группы геномный исследований
  • Старший научный сотрудник Кисличкина Ангелина Александровна
    Тел.: +7 (4967) 31-21-56

*Для проведения работ необходимо подать заявку на бланке организации-заявителя. Для ускорения переписки рассматриваются факсимильные и электронные копии документов. Заявки необходимо отправлять на факс: +7 (4967) 36-00-03 или электронный адрес: Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.. В заявке желательно указать контактные данные исполнителя.

Список и стоимость услуг, предоставляемых Группой геномных исследований ФБУН ГНЦ ПМБ
НаименованиеЦена
1. Геномное секвенирование штаммов бактерий
Предварительная идентификация микроорганизма, выделение ДНК микроорганизма, приготовление библиотеки, секвенирование, биоинформационный анализ. При необходимости может быть проведена лиофилизация культуры микроорганизма, или подготовка к другому варианту длительного хранения.		 от 30 000 руб. за геном
2. Секвенирование 16S рРНК (16S метагеномика)
Выделение фракции ДНК из образца, амплификация гена 16S рРНК, подготовка библиотеки для секвенирования, секвенирование на платформе MiSeq, биоинформационный анализ.		 от 30 000 руб. за образец
3. Тотальное секвенирование ДНК образа сообщества микроорганизмов (Shot gun метагеномика, метагеномный анализ методом дробовика)
Выделение ДНК из образца, подготовка библиотеки для секвенирования, секвенирование на платформе MiSeq, биоинформационный анализ.		 по договорённости
4. Мономолекулярное нанопоровое секвенирование штаммов бактерий
Предварительная идентификация микроорганизма, выделение ДНК микроорганизма, приготовление библиотеки, секвенирование на системе MinION, биоинформационный анализ. При необходимости может быть проведена лиофилизация культуры микроорганизма, или подготовка к другому варианту длительного хранения. Секвенирование на системе MinION во многих случаях позволяет реконструировать полные последовательности бактериальных хромосом и плазмид. Однако частота возникновения ошибок при проведении подобных исследований значительно ниже, чем при проведении геномного секвенирования на оборудовании Illumina.		 от 50 000 руб. за геном
5. Полногеномное секвенирование бактериальных штаммов с использованием технологии гибридного секвенирования
Гибридное секвенирование основывается на сочетании мономолекулярного нанопорового секвенирования (MinION) и секвенирования путем синтеза на оборудовании Illumina. Работа включает секвенирование генома с использованием обеих платформ, а также биоинформационных анализ данных. В подавляющем большинстве случаев удаётся реконструировать полные (кольцевые) последовательности бактериальных хромосом и плазмид. При этом подходе значительно снижается количество неправильно определенных оснований.		 от 100 000 руб. за геном
6. Биоинформационный анализ данных
Сборка геномов, анализ принадлежности к филогенетической группе, поиск маркеров устойчивости к антимикробным препаратам, а также другая работа, в том числе размещение данных на серверах NCBI и подготовка публикаций в журналы.		 по договорённости
KREMLIN.RU width=Сайт Президента Российской Федерации
GOVERNMENT.RUСайт Правительства Российской Федерации
ROSPOTREBNADZOR.RUСайт Роспотребнадзора Российской Федерации
OPEN.GOV.RUСайт Министерства здравоохраниения Российской Федерации
GOSUSLUGI.RUПортал Государственные услуги
YOUNGSCIENCE.RUПрезидент России молодым ученым и специалистам