Повышение квалификации

«ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ПОДХОДЫ В ЛАБОРАТОРНОЙ ДИАГНОСТИКЕ И ПРОФИЛАКТИКЕ ИНФЕКЦИОННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ»

Видеоролики практических занятий

ТемаКраткое описание
1. Выделение ДНК, основные этапы Основные этапы выделения ДНК из биологических образцов: получение биологического образца; разрушение клеточной стенки, капсулы, биологических мембран; депротеинизация; очистка, переосаждение, растворение ДНК; проверка качественного и количественного выхода ДНК. Особенности выделения ДНК для полногеномного секвенирования
Видеофайл «Выделение ДНК»
2. ПЦР в режиме реального времени ПЦР в режиме реального времени, суть метода, особенности постановки, учета и оценки результатов, достоинства, недостатки. Флуоресцентные методы детекции, их разновидности и особенности. Мультиплексная ПЦР в режиме реального времени. Применение ПЦР в режиме реального времени для различных целей
Видеофайл «ПЦР в режиме реального времени»
3. NGS секвенирование:
суть, основы применения секвенирования
NGS секвенирование. Методы секвенирования ДНК первого, второго, третьего поколения. Суть методов, основные этапы, в т.ч. подготовка библиотек, биоинформационный анализ. Основы применения секвенирования
3.1. Подготовка библиотек Видеофайл «Подготовка библиотек»
3.2. Запуск прибора для секвенирования GenoLab M Видео файл «GenoLab M подготовка к запуску»
3.3. Запуск прибора для секвенирования Illumina MiSeq Видеофайл «Illumina MiSeq подготовка к запуску»
3.4. Биоинформационный анализ данных секвенирования. Основы применения секвенирования Видеофайл «Анализ данных секвенирования»
4. Клонирование, методы и инструменты молекулярного клонирования Клонирование, суть метода, основные этапы. Подбор подходящего для исследования вектора, например, плазмиды. Выделение плазмидной ДНК из бактериальной культуры экспресс-методами. Выделение и очищение целевого фрагмента ДНК: вырезание с помощью эндонуклеаз рестрикции, копирование методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) и др. Линелизация плазмиды при помощи эндонуклеаз рестрикции. Визуализация результатов рестрикции методом гель-электрофореза в агарозном геле. Приготовление лигата - сшивка плазмиды и целевой последовательности. Трансформация лигата в реципиентные клетки. Трансформация компетентных клеток. Анализ трансформантов. Применение клонирования для различных целей
Видеофайл «Клонирование»
5. Трансформация компетентных клеток, особенности методологии Трансформация, суть метода, механизм трансформации. Разновидности трансформации. Компетентные клетки, используемые для трансформации, особенности методологии. Применение трансформации для различных целей
(Видеофайл «Клонирование»)